تحليل بيانات DNA-sequencing

السلام عليكم ورحمة الله،

أبحث عن مختص في المعلوماتية الحيوية (Bioinformatician) لتحليل بيانات تسلسل جينومي لنباتات، تم الحصول عليها بتقنية HiFi (High-Fidelity) من منصة PacBio، وهي بيانات طويلة القراءة وعالية الدقة.

نطاق العمل يشمل:

•تنظيف وفلترة قراءات HiFi

•التجميع الجينومي (De novo genome assembly)

•تقييم جودة التجميع (Assembly quality assessment)

•تحليل المحتوى الجيني والتنوع الوراثي

•بناء شجرة علاقات وراثية (Phylogenetic analysis)

•تقديم تقرير علمي يتضمن رسوم بيانية وتحليل واضح للنتائج

المتطلبات:

•خبرة مثبتة في التعامل مع بيانات PacBio HiFi أو long-read عمومًا

•إتقان أدوات مثل: Hifiasm, Flye, BUSCO, QUAST, Bandage، بالإضافة لأدوات التحليل الإحصائي مثل R أو Python

•معرفة بتحليل جينومات النباتات تعتبر ميزة قوية

•القدرة على تسليم العمل بجودة عالية وفي الوقت المحدد

عند التقديم، يرجى:

•إرفاق أعمال أو مشاريع سابقة مشابهة (إن وُجد)

•توضيح الأدوات التي تجيد استخدامها

•تقدير مبدئي للتكلفة والمدة المطلوبة

ملاحظة: المشروع يمثل جزءًا من دراسة بحثية على نباتات محلية، وقد يمتد لتعاون بحثي طويل الأمد.

بانتظار عروضكم الجادة