أداة تحليل تسلسل DNA مع تكامل AlphaFold

هذا المشروع عبارة عن تطبيق Bioinformatics متكامل لتحليل تسلسل DNA، كشف الطفرات، وتحليل تأثيرها على البروتينات، بالإضافة إلى عرض ثلاثي الأبعاد للهياكل البروتينية باستخدام AlphaFold.

الميزات الأساسية:

تحليل تسلسل DNA فردي: التحقق من صحة التسلسل، إحصاءات النوكليوتيدات، توليد النسخة العكسية، تحليل الكودونات، واستخراج ORFs.

مقارنة الطفرات: كشف الإضافات والحذوفات والتبادلات، تصنيف الطفرات، مقارنة تسلسل البروتين وتحليل تأثير الطفرات (Silent، Missense، Nonsense، Frameshift).

عرض ثلاثي الأبعاد: مشاهدة هياكل البروتين التنبؤية من AlphaFold أو قواعد بيانات RCSB PDB، مع تحكم تفاعلي (تدوير، تكبير/تصغير، تغيير الأنماط).

التقنيات المستعملة: Python، Streamlit، Plotly، 3Dmol.js، Pandas، NumPy، Requests، AlphaFold API، UniProt API.

نتائج الاختبارات: جميع الوظائف الأساسية تم اختبارها ونجحت بنسبة 100%.

التطبيق يوفر واجهة نظيفة وسهلة الاستخدام ويمكن للزائر تجربة التحليل مباشرة دون الحاجة لتحميل أي ملفات.

رابط المشروع: https://biogenappanalyzer...