تحليل بيانات مرضى سرطان الثدي (BRCA)

يتناول هذا المشروع تحليل بيانات لمجموعة من مرضى سرطان الثدي (BRCA)، حيث يجمع بين بيانات تتعلق بخصائص المرضى مثل العمر، والنوع، وخصائص الورم، ووضع مستقبلات الهرمونات، ونوع الجراحة، وتواريخ المتابعة الطبية. الهدف من المشروع هو فهم العوامل المؤثرة في تطور المرض ونتائج العلاج عبر استكشاف العلاقات بين هذه المتغيرات والبيانات البروتينية.

نظرة عامة على البيانات:

تشمل البيانات سمات متعددة من ضمنها:

المعلومات الديموغرافية والسريرية:

العمر عند التشخيص: تصنيف المرضى حسب العمر يساعد في تحديد فئات الخطر.

النوع: تحديد اختلافات الإصابة حسب الجنس.

المرحلة السريرية للورم (Tumor Stage): لتصنيف مدى تقدم الورم.

نوع الجراحة وتاريخها: مثل "لومبكتومي" و"ماستكتومي"، مع تسجيل تاريخ الجراحة للربط مع الفعالية العلاجية.

الحالة الصحية الحالية: متابعة الحالة الصحية للمرضى (على قيد الحياة أو وفاة).

بيانات التعبير البروتيني:

مستويات بروتينات محددة تعكس العمليات البيولوجية المتعلقة بالورم، مما يساهم في تقييم شدة المرض والتنبؤ بنتائج العلاج.

التحليل الاستكشافي للبيانات (EDA):

تم استخدام أدوات تحليل استكشافية لتقديم رؤى واضحة حول البيانات وتحديد اتجاهات الإصابة والنجاة حسب العمر والجنس، ومستويات البروتينات المرتبطة بمراحل الورم وأنواعه. ومن أبرز النتائج:

توزيع الأعمار والأجناس: تم تحديد الفئات العمرية الأكثر عرضة للإصابة.

نجاح أنواع الجراحات: تبين أن عملية "لومبكتومي" حققت أعلى معدلات النجاة.

تحليل مستقبلات HER2 وER: يوفر رؤى حول مدى تأثير هذه المستقبلات على نتائج العلاج ونجاح الجراحة.

لوحة تحكم تفاعلية:

تم تصميم لوحة تحكم تفاعلية لمساعدة المتخصصين في الرعاية الصحية على الوصول إلى البيانات والتحليلات بسهولة، مما يتيح تتبع مسارات المرضى وفهم التأثيرات المحتملة لأنواع العلاجات المختلفة.

النموذج التنبؤي باستخدام خوارزمية XGBoost وSMOTE:

لتجاوز مشكلة التوازن بين فئات البيانات المتاحة، تم استخدام خوارزمية XGBoost، مع تقنيات المعاينة الزائدة الاصطناعية SMOTE لتحسين دقة النماذج التنبؤية. يساعد هذا النموذج في تحسين التنبؤ بمعدلات البقاء وتحليل العوامل المؤثرة في ذلك، مما يساهم في اتخاذ قرارات علاجية فعّالة تعتمد على البيانات.

لوروية الكود على github:

https://github.com/Eslam-...

لرويه لوحة التحكم :

https://public.tableau.co...